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恶性胸腔积液能用来基因检测吗?

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10745 1 小曲 发表于 2019-5-30 18:34:22 |

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恶性胸腔积液能用来基因检测吗?

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近年来,随着分子生物学技术的发展,对肿瘤发病机制从细胞、分子水平的进一步认识,表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)在发生 EGFR 敏感突变的非小细胞肺癌患者的治疗中取得了显著效果。
随着测序成本以超“摩尔定律”的速度下降,基因检测将越来越普及化,我们知道市场上基因检测最常见的样本类型有:唾液、口腔拭子、EDTA抗凝血、血浆游离DNA、组织(蜡块/蜡卷/切片/冰冻组织/甲醛固定组织等)、粪便等。

说到靶向用药,样本检测的类型基本上都是血液和组织。众所周知,血液虽然取样方便、无创或创伤小,但是阳性检出率低于组织。组织虽然是业界的“黄金标准”,但是70% 以上的患者在确诊时已属晚期,失去了手术机会,从而难以获得用于检测 EGFR 基因突变的组织学标本。

那么还有没其他检测方式呢?

胸腔积液(胸水)

胸腔积液常称之为胸水,是一种常见的肿瘤并发症,约50%以上的肺癌患者在疾病过程中将出现胸腔积液。一旦出现,患者的生活质量将会受到明显的影响,容易出现发热、胸闷、呼吸困难等现象。
如果肿瘤控制不住,恶性胸水是一直存在的,而且会逐渐加重。恶性胸水里癌细胞的比例往往非常高,而且胸水的癌细胞也与目前进展期病灶的基因突变相近,所以胸水可以作为一种很好的基因检测样本类型。

基因检测

复旦大学附属中山医院呼吸科暨上海市呼吸病研究所童琳博士在2017 WCLC的报告显示:肺癌患者胸水上清液中的肿瘤来源DNA(etDNA)有望用于基于二代测序(NGS)的基因突变检测。

针对63例肺癌患者(58例腺癌,2例腺鳞癌,2例小细胞肺癌和1例神经内分泌癌)的肿瘤组织(Tissue-DNA)、胸水(etDNA和ETC-DNA)和同期的血浆ctDNA,通过NGS进行基因检测,其中30例患者具有匹配的肿瘤组织标本。

结果发现在分别检测的etDNA、ETC-DNA和ctDNA标本中,etDNA的肿瘤特有突变检出率比ETC-DNA和ctDNA都高。etDNA中所检出突变的丰度比ETC-DNA和ctDNA均高,而与组织相近。etDNA的基因变异类型和分布与组织接近。

这项研究表明,与ETC-DNA和ctDNA相比,etDNA具有更高的肿瘤特有突变检出率和敏感性。从胸水上清液中获取的etDNA可以作为基因突变检测的优质标本来源,用于指导肺癌患者的治疗决策。

来自北京大学肿瘤医院的研究证明,对于无法使用组织检测 EGFR 突变的患者而言,肿瘤恶性胸水检测也可能是一种选择。

这项研究回顾性地收集了 295 份肿瘤恶性胸水样品,其中的 92 份具有匹配的肿瘤组织样本,248 份具有匹配的血浆样本。

研究使用了变性高效液相色谱法(DHPLC)分别评估比较了肿瘤恶性胸水、肿瘤组织和血浆中的 EGFR 外显子 19 缺失和外显子 21 的 L858R 突变,探索了肿瘤恶性胸水中的 EGFR 突变检测结果对于治疗的指导意义。

结果发现,295 份肿瘤恶性胸水样本中有 116 份可以检测出 EGFR 突变(39.3%),肿瘤恶性胸水结果与组织检测结果的一致性为 87.1%。

以肿瘤组织中的 EGFR 检测结果为标准,肿瘤恶性胸水样本 EGFR 突变检测的敏感度为 71.4%、特异度为 96.5%。

在 219 名接受了 EGFR-TKI 治疗的患者中,以肿瘤恶性胸水、肿瘤组织或血浆检测出 EGFR 突变患者的客观缓解率(57.6% vs 56.0% vs 47.4%)、无疾病进展时间(8.9 月 vs 9.0 月 vs 7.7 月)以及总生存期(29.8 月 vs 25.9 月 vs 25.3 月, p = 0.33)的结果相近,表明肿瘤恶性胸水可以作为肿瘤组织标本的替代物检测 EGFR 突变并能够有效地指导患者的治疗,作为晚期肺腺癌患者 EGFR-TKI 用药决策的参考。
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总结

对于无法使用组织检测 EGFR 突变的患者而言,肿瘤恶性胸水检测可能也不失为一种选择。恶性胸腔积液是晚期 NSCLC 患者常见的症状,获得较为容易。应用胸腔积液不仅可进行常规的病理诊断,还为实施 EGFR 基因突变检测提供了可能。

同时,患者和家属也应该注意:如果要对胸水上清液中的游离肿瘤DNA(etDNA)进行基因检测,还需要选择实力强、口碑好的基因检测公司。

因为这种检测方法要求很高,通常需要几万X的测序深度及万分之几的灵敏度,号称几千X测序深度便可达到万分之几灵敏度的液体活检公司就可以放弃了,基因检测报告基本是阴性报告。
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1条精彩回复,最后回复于 2024-3-30 18:09

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[LV.1]初来乍到
zqlzj007  大学一年级 发表于 2019-7-31 02:03:29 | 显示全部楼层 来自: 中国
我父亲耐药时也用心包积液在广州金域做过基因检测,依然是19突变,没有其他的突变.用9291控制了半年,后来又耐药了,用血液做检测,没有任何突变,盲试9291+184,有效.
希望

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